World Series Baseball fait son apparition pour la saison 2003. Ce volet comprend un mode franchise approfondi qui permet aux joueurs de gérer leurs entraîneurs et leurs équipes de ligue mineure, en y jouant pendant un nombre illimité de saisons. Dans ce qui est presque devenu une norme pour la série, le mode Créer un joueur est présent pour que les joueurs puissent créer leurs propres équipes. Les modes Saison, Exhibition, Home Run Derby et Playoffs sont également proposés. Les petits extras incluent la sauvegarde des statistiques du joueur dans un profil d'utilisateur, ainsi que des joueurs et des uniformes de l'ancienne génération. Le jeu utilise des licences de la MLBA, du MLB Players Choice, du National Baseball Hall of Fame, de la Cooperstown Collection et des World Series 2002.