Le jeu inclut un mode histoire qui, tout comme Zoids Saga, interagit certaines émissions TV Zoids. La parution n'a eu lieu qu'au Japon, ce qui signifie que ce jeu ne peut être obtenu hors du Japon que par import ou téléchargement d'une ROM. Dans l'histoire, un jeune pilote appelé Kein cherche sa sœur aînée Sheryl, qui a disparu il y a un an de cela dans un mystérieux incident faisant intervenir un Death Saurer. Dans ce jeu, les Zoids sont personnalisables, permettant au joueur d'améliorer des pièces en gagnant des points dans d'autres zones du jeu.
