L'histoire de Voltage Fighter: Gowcaizer prend place dans le futur. Le Japon a été ravagé et le gouvernement s'est établi sur une île artificielle dans la baie de Tôkyô. Un ordinateur central gère tout : sécurité, nettoyage, circulation, etc. Au milieu de l'île se trouve le National Bernard Institute, où il y a plusieurs milliers d'étudiants. Depuis qu'un nouveau directeur y a été nommé, les actes de violence ont beaucoup progressé, comme s'il en était la cause. Un étudiant, Isato Kaiza, a trouvé le moyen de puiser la puissance de la pierre Kaizer. Il devient ainsi Gowcaizer, le Burning Hero.
