Snatcher se déroule dans la ville futuriste de Neo Kobe, une ville de folie et de décadence. Nous sommes en 2047. L'humanité est confrontée à sa plus grave crise. Une mystérieuse forme de vie bio-roïde est apparue. Sa vraie nature et son but sont inconnus. Est-ce l'arme secrète d'un pays ou extraterrestre ? Ils apparaissent en hiver, tuent les gens et prennent leur place dans la société. Ils ont une peau artificielle, transpirent et saignent. Une nouvelle force de police, spécialement formée pour combattre les Snatchers, a été formée : les JUNKERs. Chaque fois que vous rencontrez quelqu'un, vous devez vous poser une question difficile : est-ce une personne ou un snatcher ? Le joueur prend le contrôle de Gillian Seed, un JUNKER. Le gameplay suit largement la structure d'une aventure de style japonais. Le joueur utilise une interface pilotée par des menus pour exécuter des commandes, ce qui inclut le déplacement entre les lieux et l'interaction avec l'environnement.