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Dans une zone reculée de l'univers, une créature extraterrestre appelée Zelos est née. Au fur et à mesure qu'il grandissait, son appétit augmentait et il commença bientôt à dévorer des galaxies, des planètes et des étoiles par centaines. Aujourd'hui, votre planète s'est retrouvée sur le chemin de Zelos, et c'est à vous et à votre partenaire de vous lancer dans la bataille pour sauver votre monde. Six niveaux alternent entre défilement latéral et vertical, chacun d'entre eux se terminant par un puissant Boss. Tout au long du jeu, la destruction de certains ennemis libère des bonus qui peuvent être utilisés pour équiper votre vaisseau d'armes plus puissantes, d'une vitesse accrue et de boucliers.
