Puzzle Link est un jeu où les blocs de couleur correspondante doivent être dissous. De nouveaux blocs défilent constamment dans l'écran depuis le haut. Le jeu est terminé lorsque les premiers blocs atteignent le bas de l'écran. Vous pouvez dissoudre les blocs en leur tirant dessus. Les tirs forment une ligne à l'endroit de leur impact. Si cette ligne relie des blocs de la même couleur qui ne sont pas reliés entre eux, ils se dissolvent. Il existe trois modes différents : Dans "Normal", vous devez relier deux blocs spéciaux qui apparaissent après un certain temps. Si vous parvenez à terminer le niveau dans le temps imparti, vous débloquerez l'une des 50 cartes à collectionner. Dans le mode "Clair", vous devez éliminer une constellation donnée de blocs. Le mode "Bataille" est un mode de liaison à deux joueurs.
