Ninja Gaiden III : The Ancient Ship of Doom est un jeu vidéo de plates-formes/action, troisième épisode de la trilogie du Ninja Gaiden sur NES mais qui n'a jamais été édité en Europe. L'histoire se passe entre les événements de Ninja Gaiden et Ninja Gaiden II. Le joueur contrôle Ryu Hayabusa, faussement accusé du meurtre d'Irene Lew, agent de la CIA qu'il sauve dans le premier Ninja Gaiden, et part mener l'enquête sur l'identité et les motivations de ceux qui ont monté cette machination contre lui. De rebondissements en révélations, le scénario intègre également des éléments de science-fiction jusque-là inédits dans la série, comme le voyage dans l'hyperespace, la transformation génétique, et la présence d'un vaisseau spatial. Le gameplay est similaire à celui des précédents jeux de la série, tout en enrichissant les habilités de Ryu Hayabusa, qui peut désormais s'accrocher par dessous à des tuyaux et des rampes, peut allonger son épée grâce à des améliorations et tirer à la verticale lorsque le besoin s'en fait sentir.
