Jumping Flash ! 2 : Big Trouble in Little Moo suit les aventures de Robbit, un lapin robot volant piloté. Le but est de sauver tous les moo-moos, petites créatures extraterrestres, et d'arriver à la sortie. Le baron Aloha, le méchant du jeu original Jumping Flash ! est de retour sur sa planète natale de Little Moo pour préparer sa revanche.