Dans un univers DC alternatif, Superman devient un tyran après la mort de Lois Lane, et Batman mène la résistance. Les héros et vilains s'affrontent dans une guerre idéologique où chaque décor devient une arme. L'Ultimate Edition inclut tous les DLC, 6 personnages supplémentaires, plus de 40 costumes et 60 missions S.T.A.R. Labs, offrant l'expérience de combat la plus complète du jeu.