Lors de l'Incident du XGC (X-Genome Code), il y a un an, des émeutes ont été déclenchées sur la terre par des bêtes qui ne présentaient pas le XCG, et dans tout le pays, de petits tremblements de terre ont secoué la terre. La cause était inconnue, mais lorsque l'incident de Crest a pris fin et que les émeutes et les tremblements de terre se sont calmés, les gens ont commencé à affirmer que tout était dû à l'influence du Sceau de Pierre. Bien que le Sceau de Pierre ait été enfermé, les émeutes et les tremblements de terre sont revenus. Il s'agit à nouveau d'un jeu de combat en 3D avec les capacités de transformation caractéristiques de la série. Contrairement aux précédents titres de la série, la jauge de la bête fait désormais office de barre de santé, si la jauge de santé d'un personnage est épuisée, il se transforme automatiquement. Le jeu propose 18 combattants jouables et une variété de modes de jeu, dont les modes arcade, versus, ...